ASO反义核酸设计网站_核酸免费
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反义寡核苷酸脱靶如何预测下游靶基因反义寡核苷酸ASO是一种短链的合成寡核苷酸长度通常在16到53个核苷酸之间它的主要作用是通过与RNA包括miRNA高度互补来阻断RNA的功能ASO的结构通常包含化学修饰的核苷酸或在两端添加特定序列以提高其与靶序列的结合亲和力并使其能够抵抗细胞内核酸酶的降解ASO的主要作用是干扰DNA转化为信使RNAmRNA的关键阶段mRNA是制造蛋白质的模板如果被去除蛋白质就无法被制造ASO是一种合成性的DNA片段能够与mRNAs结合从而诱发其被切成碎片ASO治疗药物通常长度为1620个核苷酸由化学修饰的核苷酸组成位于DNA中央部分的两侧主要通过硫代磷酸连接当ASO通过WatsonCrick碱基对与靶RNA序列特异性结合时中心DNA区域形成DNARNA杂交体引发核糖核酸酶H1切割RNA链目前关于ASO脱靶后下游靶基因的预测问题仍然是一个研究热点如果你对这个问题感兴趣欢迎大家一起探讨
蒂莫西综合征新治ASO策略最近的研究表明蒂莫西综合征TS的一个关键变体CACNA1C外显子8A通过干扰剪接机制直接且持续地增强了其自身的丰度剪接调控因子PTBP1在这个过程中起到了重要作用影响了第8外显子与第8A外显子的选择筛选有效的反义寡核苷酸为了减少外显子8A的表达支持人类神经细胞中外显子8的CACNA1C亚型我们设计了一种ASO行走策略我们制作了5个核苷酸nt间距覆盖8A外显子的反义寡核苷酸ASOs并使用了一种通用的2O甲氧基乙基核糖MOE修饰的ASOs以避免CACNA1CmRNA的潜在降解实验验证我们将TShiPS细胞分化为hCO并将其分离为二维神经培养然后我们添加了10的ASO靶向8A外显子或干扰对照ASOASOScr或AScr三天后通过逆转录定量PCRRTqPCR检测发现一些ASOs在不改变8外显子表达的情况下显著诱导了8A外显子的下调三维培养验证为了在三维hCO中验证这些结果我们选择了前四种ASOsASO14ASO17ASO18和ASO20在三维类器官培养中暴露于ASOs3天也产生选择性外显子8A下调RTqPCR分析和RFLP进一步证实了这些结果药效学研究为了研究这些ASOs的药效学我们用不同浓度的ASO处理hCO分化第3090天范围为000110我们观察到8A外显子表达的剂量依赖性下降最后为了证明ASOs的渗透效果我们对ASO进行了标记用流式细胞术从hCO中分离Cy5细胞大部分细胞包括表达CD90的神经元均为Cy5这表明人类神经元吸收ASO并能以剂量依赖的方式在短时间内降低该TS模型中8A外显子的表达这些实验为我们提供了新的治疗蒂莫西综合征的可能性通过精准的基因调控来减少有害的外显子表达未来的研究将进一步探索这些ASOs的临床应用潜力
反义寡核苷酸基因沉默的三大策略反义寡核苷酸ASO是一种强大的基因沉默工具其工作原理主要有三种空间位阻效应ASO与mRNA结合后形成空间位阻阻止mRNA进入核糖体进行蛋白质翻译从而下调基因表达碱基互补配对ASO通过碱基互补配对与靶标mRNA结合招募RNA酶将其降解进而抑制基因表达外显子剪切ASO结合于premRNA的某个外显子区域导致这段外显子被剪切掉最终生成的mRNA中不包含这段外显子此外ASO还有其他作用机制例如与miRNA结合抑制miRNA的作用从而提高蛋白效率结合mRNAUTR区抑制mRNA蛋白翻译结合外显子和内含子区域实现外显子剪切跳跃结合启动子区域实现启动子区域甲基化或乙酰化等作用改变基因表达水平尽管ASO有其优势但也有两大缺点与目标RNA的亲和力低下和容易被核酸酶降解为了克服这些缺点可以进行化学修饰主要的修饰方法有两种PS键修饰将磷酸基中的一个氧替换为硫增加了抗核酸酶降解的稳定性PS键的负电荷分布更广泛增加了ASOs的亲脂性促进了与血浆蛋白的结合从而促进ASOs进入细胞和组织中研究表明PSASO可以招募RNaseH酶来促进靶RNA的切割PMO修饰MorpholinoASO是中性的不会激活RNaseH因此Morpholinos经常用于翻译抑制或其他位阻机制主要包括基因剪接的改变等功能通过这些修饰方法可以有效提高ASO的稳定性和亲和力从而更好地实现基因沉默和其他生物功能
牛津大学医学博士全奖项目儿科领域新突破牛津大学儿科系博士生项目招生开发神经发育不全症的反义寡核苷酸和碱基编辑疗法项目亮点神经发育不全症是一类影响神经系统正常发育的疾病目前治疗手段有限亟需创新性解决方案该项目专注于研究这些疾病的基因失衡半量不足并通过基因激活策略提高疾病相关基因的表达具体研究方法包括利用反义寡核苷酸ASO和CRISPRCas9碱基编辑技术来靶向并破坏上游开放阅读框uORF从而上调关键蛋白的表达已初步筛选出超过10个潜在可靶向的神经发育相关基因未来将在此基础上进一步验证和扩展项目目标是开发针对多种目前无法治疗的神经发育疾病的候选药物博士生导师主导师DrThomasRobertsProfMatthewPAWood副导师DrDhanuGupta研究领域神经发育不全症基因治疗反义寡核苷酸与CRISPR技术基因表达调控项目研究方向基因激活策略通过靶向破坏uORF恢复和增加与疾病相关蛋白质的表达反义寡核苷酸和CRISPRCas9技术研究如何利用这些尖端技术来解决神经发育疾病中基因表达的不足问题药物筛选筛选出可以针对这些uORF的分子药物开发全新的治疗神经发育不全症的候选药物申请信息学制全职3至4年所属系牛津大学儿科系申请截止日期请尽早提交申请建议详细阅读申请指南项目代码MRCTGCORE2024005申请条件我们诚邀全球具备相关背景的优秀博士申请人不论你是否已有相关研究经验只要你对基因治疗和神经发育疾病研究充满热情这将是一个难得的机会让你参与到前沿的创新研究中
渐冻症治疗新突破基因疗法与脑机接口技术渐冻症肌萎缩侧索硬化症ALS是一种严重的神经退行性疾病目前尚无根治方法但近年来在治疗方面取得了显著进展以下是渐冻症最新治疗进展的详细信息基因疗法基因疗法在渐冻症治疗中取得了重大突破2023年4月美国FDA批准了反义寡核苷酸ASO药物Toferson用于治疗携带SOD1基因突变的渐冻症患者这种药物通过鞘内注射给药靶向突变SOD1基因的mRNA促进其降解从而减少突变型SOD1蛋白和神经丝轻链NfL显著减缓疾病进展此外国内药企神济昌华自主研发的AAV基因治疗药物SNUG01也显示出良好的安全性和疗效新药物研发除了基因疗法外其他新药物也在研发中例如ImmunityPharma的IPL344在临床试验中显示出显著的疗效能够减缓疾病进展并改善患者的体重呼吸功能和生存率此外RAG17作为一种针对SOD1基因突变的创新疗法在研究者发起的临床研究中取得了积极结果脑机接口技术新型脑机接口系统为渐冻症患者提供了新的沟通方式通过在患者大脑中植入脑机接口设备并将脑信号解码转换成语音使患者能够重新说话这为改善患者生活质量带来了希望中药治疗中医药在渐冻症治疗中也展现出潜力河北以岭医院启动了一个中药创新药II期临床试验该药物基于中医络病理论研制有望在后续临床试验中进一步验证其效果国际合作与研究蔡磊与华大集团的合作推动了渐冻症研究的进展双方成立了多组学研究联合实验室旨在加速对渐冻症的理解与治疗
RNA药物从机制到未来挑战与机遇一RNA药物简介RNA药物顾名思义就是以RNA为核心的治疗方式它们利用RNA与生物体内基因的复杂关系来实现治疗具体来说RNA药物通过以下几种机制发挥作用基因敲除通过靶向特定基因的RNA来抑制其表达比如siRNA基因修正纠正有缺陷的RNA例如ASO蛋白质表达用mRNA编码蛋白质以替代缺失或异常的蛋白质比如COVID19疫苗基因编辑直接修改DNA序列例如CRISPR技术RNA药物的工作原理RNA药物利用细胞内天然存在的机制进行靶向调控以下是常见的RNA药物类型短RNA分子反义寡核苷酸ASO单链RNA与目标RNA结合阻止其功能或触发降解例如用于脊髓性肌萎缩症SMA的药物nusinersen小干扰RNAsiRNA双链RNA加入细胞的RNA干扰机制切割目标RNA例如用于高胆固醇的药物inclisiran适配体Aptamer具有高结构特性的RNA用于特异性结合并抑制靶标蛋白例如用于眼部疾病的药物avacincaptadpegol长RNA分子信使RNAmRNA编码蛋白质的RNA用于补充缺失的蛋白或引发免疫反应例如COVID19疫苗CRISPRRNA指导基因编辑酶如Cas9定位和编辑目标基因RNA药物的挑战虽然RNA药物有巨大的潜力但它们也面临一些挑战RNA的不稳定性RNA是一种非常易降解的分子在体内的稳定性有限递送问题RNA需要精准递送到目标细胞才能发挥作用毒性和免疫反应RNA药物可能激活人体的免疫系统导致炎症反应或其他副作用成功的案例COVID19疫苗mRNA疫苗使用RNA编码病毒蛋白帮助人体识别和防御病毒Patisiran一种siRNA药物通过LNP递送靶向肝脏降低引发疾病的蛋白水平NTLA2001使用mRNA和CRISPR技术首次在人体内实现基因编辑未来的发展方向技术进步自扩增RNAsaRNA环状RNAcircRNA基因编辑工具改进新的递送策略开发能针对肺肌肉等组织的递送技术克服物种差异小鼠模型的结果并不总能反映人类的真实情况总结RNA药物是一种创新的治疗方式它们通过多种机制发挥作用为许多疾病提供了新的治疗选择尽管面临一些挑战但随着技术的不断进步和新的递送策略的开发它们在未来的医疗领域中将发挥越来越重要的作用
福医大团队新突破PFBC有戏最近福建医科大学陈万金教授团队在神经领域的顶级期刊Neuron上发表了一项引人注目的研究针对原发性家族性脑钙化症PFBC提出了一种潜在的基因治疗策略这项研究不仅在学术上具有重要意义更为PFBC患者带来了新的希望PFBC是一种遗传性神经疾病目前尚无有效治疗方法研究团队通过增强SLC20A2基因表达恢复脑内磷酸盐稳态为PFBC治疗提供了新的可能研究发现SLC20A2基因内含子变异会导致异常剪接降低SLC20A2mRNA和蛋白表达通过反义寡核苷酸ASOs技术研究团队成功恢复了SLC20A2的正常剪接和表达此外研究还提出了calcificationrepressionbyASOcorrectedexpressionCRACE疗法为PFBC的临床治疗提供了新思路科研是一场永无止境的探索旅程每一项重大发现都能点亮希望之光这篇高质量的SCI论文展示了科研如何通过深入探索分子机制和创新技术为人类健康作出贡献
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